HKL edistää pyöräilyä kehittämällä kaupunkipyöräjärjestelmää, pyöräasemia ja pyöräilyyn liittyviä palveluita.
Kaupunkipyöräjärjestelmän ideana on tukea joukkoliikenteen käyttämistä, mahdollistaa liityntämatkoja ja lisätä lyhyitten pyörämatkojen sujuvuutta keskustassa. Kaupunkipyörät on tarkoitus ottaa käyttöön vaiheittain ja kasvattaa järjestelmää vähitellen. Täydessä laajuudessaan järjestelmä käsittäisi 150 pyöräasemaa ja 1500 pyörää. Järjestelmä valmistuu lähivuosina.
HKL kehittää pyörien liityntäpysäköintiä metro- ja juna-asemilla yhteistyössä muiden toimijoiden kanssa. Puotilaan ja Vuosaareen on toteutettu viime ja tänä vuonna uusia polkupyörien liityntäpysäköintipaikkoja yhteensä noin 250. HKL ja HSL avasivat keväällä Vuosaaren metroasemalla ns. Pyöräparkin, jonka lukittaviin säilytyskaappeihin voi jättää polkupyörän turvalliseen talteen. Matka jatkuu kätevästi metrolla. Kaapit toimivat HSL:n matkakortilla.
HKL vastaa kaupungin keskustassa kesäaikaan toimivan Pyöräkeskuksen toiminnasta. Pyöräkeskus neuvoo maksutta pyöräilyyn liittyvissä asioissa ja lainaa työkaluja pyörän huoltamiseen.